小琉球擁有便利的交通及獨特的地理與海洋生物資源(如珊瑚礁、海龜等)，近年來因觀光迅速擴張及氣候變遷影響下，海洋生態面臨嚴峻挑戰。為維護這一片珍貴的海洋資源，海洋委員會攜手屏東縣政府與大鵬灣國家風景區管理處提出「珊瑚礁生態系統保育」、「強化潮間帶管理」及「遊憩承載量評估」等三大方案，盼以多管齊下的策略，有效解決小琉球面臨的困境，確保珊瑚礁與海洋生物的永續發展。